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人乳頭瘤病毒cp6108的序列研究 【?2005-12-30 發(fā)布?】 臨床報道
(南京)為了對尖銳濕疣中人乳頭瘤病毒(HPV)cp6108進(jìn)行序列研究。研究者應(yīng)用TA克隆后測序和PCR產(chǎn)物直接測序進(jìn)行HPV cp6108的基因序列測定。結(jié)果 5例HPV cp6108陽性的尖銳濕疣的模板DNA經(jīng)TA克隆后測序和PCR產(chǎn)物直接測序結(jié)果顯示,兩種測序結(jié)果一致,BLAST比對結(jié)果顯示,與基因庫中HPV cp6108提交序列有99%的一致性,排在比對結(jié)果第1位,所有標(biāo)本的cp6108的序列與網(wǎng)上提交序列對比后發(fā)現(xiàn)均有3處相同的密碼子發(fā)生改變(以起始密碼子GCA之G為第1位):第210位核苷酸G(鳥嘌呤,)突變?yōu)锳(腺嘌呤),導(dǎo)致第70位密碼子GAG→GAA,發(fā)生同義突變;第229位核苷酸G(鳥嘌呤)突變?yōu)锳(腺嘌呤),導(dǎo)致第77位密碼子GAT→AAT,編碼的氨基酸由天冬氨酸(A8p,D)變?yōu)樘於0?Asn,N),即發(fā)生D77N錯義突變;第346位核苷酸A(腺嘌呤)突變?yōu)镃(胞嘧啶),導(dǎo)致第116位ACT→CCT,編碼的氨基酸由蘇氨酸(Thr,T)變?yōu)楦彼?Pro,P),即發(fā)生T116P錯義突變。可見與基因庫提交序列相比,本研究檢測到的HPV cp6108序列中有3處突變,其中G70A為同義突變,D77N和T116P為錯義突變。 /**/
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