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反向斑點(diǎn)雜交技術(shù)檢測泌尿生殖道沙眼衣原體及基因分型 【?2006-10-12 發(fā)布?】 臨床報(bào)道
(廣州)為了建立反向斑點(diǎn)雜交技術(shù),對泌尿生殖道沙眼衣原體感染進(jìn)行檢測和基因分型。研究者用0ligo軟件設(shè)計(jì)寡核苷酸探針,采用巢式聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增ompl基因的VS1-VS2序列,反向斑點(diǎn)雜交技術(shù)對沙眼衣原體進(jìn)行檢測和基因分型。結(jié)果巢式PCR擴(kuò)增ompl基因的VS1-VS2序列的敏感性與質(zhì)粒PCR符合率為98.2%(56/57)。優(yōu)選出11條型特異性(A、B+Ba、C、D、E、F、G、H、I、J和K)和3條群特異性寡核苷酸探針:B群(B、Ba、D和E型),C群(A、C、H、I、J和K型)和中間群(F和G型)。特異性經(jīng)過基因庫中的BLAST程序比較和試驗(yàn)優(yōu)化,結(jié)果顯示各探針均與標(biāo)準(zhǔn)株呈特異性雜交。56例VS1-VS2 PCR陽性的臨床標(biāo)本雜交法檢測均陽性,共檢出59株沙眼衣原體,包括8個(gè)基因型,其中以E、F、D和H型為主,占77.9%,分別為25.4%,22.0%,16.9%和13.6%。發(fā)現(xiàn)3例混合感染占5.4%,分別為D/E、D/F和F/K。可見反向斑點(diǎn)雜交技術(shù)簡便且快速,可直接對臨床標(biāo)本沙眼衣原體進(jìn)行檢測和基因分型。 /**/
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