美國(guó)國(guó)家癌癥研究所采用Fluidigm公司的96.96動(dòng)態(tài)陣列，以高成本效益對(duì)全基因組SNP聯(lián)合掃描進(jìn)行快速深入的研究

集成流體通路將促使最有希望的基因易感性標(biāo)記物更快發(fā)布

美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(National Institutes of Health，NIH)下屬的主要癌癥研究機(jī)構(gòu)國(guó)家癌癥研究所（National Cancer Institute，NCI）日前表示，該機(jī)構(gòu)正在使用Fluidigm公司的BioMark基因工程系統(tǒng)，以高成本效益對(duì)其全基因組單核苷酸多態(tài)性（SNP）聯(lián)合掃描的結(jié)果進(jìn)行快速、深入的研究。

美國(guó)國(guó)家癌癥研究所的核心基因分型技術(shù)中心（Core Genotyping Facility）采用Fluidigm公司的BioMark 96.96動(dòng)態(tài)陣列，進(jìn)行中等數(shù)量的多重（medium-plex）單核苷酸多態(tài)性基因分型。國(guó)家癌癥研究所正在進(jìn)行多項(xiàng)全基因組聯(lián)合掃描（GWAS）。上述計(jì)劃的主要目標(biāo)是，加快聯(lián)合掃描中發(fā)現(xiàn)的最有希望的基因易感性標(biāo)記物的復(fù)制和發(fā)布工作。

Fluidigm公司總裁兼首席執(zhí)行官Gajus Worthington說(shuō)，“Fluidigm的新型96.96動(dòng)態(tài)陣列能夠幫助國(guó)家癌癥研究所大幅提高其癌癥基因分型研究的服務(wù)能力。他們使用本公司48.48陣列以來(lái)一直都很順利，在他們進(jìn)行的比較測(cè)試中，F(xiàn)luidigm的新型96.96陣列的表現(xiàn)極為突出。”

Worthington又說(shuō)，“國(guó)家癌癥研究所的核心基因分型技術(shù)中心與其他政府研究中心和學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)的研究人員展開合作，共同開發(fā)用于辨別具體形式的癌癥的易感個(gè)體篩查技術(shù)。我們的96.96動(dòng)態(tài)陣列的檢出率（call rate）達(dá)到99%以上，一天能夠處理70000多個(gè)基因型。”

美國(guó)國(guó)家癌癥研究所已完成一項(xiàng)前列腺癌全基因組聯(lián)合掃描的后續(xù)深入研究，使用了近60種SNP，用標(biāo)準(zhǔn)的5’-核酸酶聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PCR）化學(xué)技術(shù)和BioMark™動(dòng)態(tài)陣列，對(duì)15000個(gè)試樣進(jìn)行了測(cè)定。2008年6月1日，在西班牙巴塞羅那舉行的歐洲人類遺傳學(xué)學(xué)會(huì)2008年年會(huì)上，美國(guó)國(guó)家癌癥研究所基因組掃描操作與分析研究帶頭人Kevin Jacobs介紹了本次研究的結(jié)果。

Fluidigm公司發(fā)明了集成流體通路（integrated fluidic circuit，IFC）。該公司的的BioMark系統(tǒng)采用集成流體通路技術(shù)來(lái)簡(jiǎn)化操作，提高通量，實(shí)現(xiàn)納升級(jí)的精密度，并能為高通量的基因分型應(yīng)用節(jié)省大量成本（試劑用量更少，試樣更小）。使用Fluidigm公司的新款96.96動(dòng)態(tài)陣列，國(guó)家癌癥研究所能夠借助96組引物-探針組合來(lái)測(cè)定96個(gè)試樣，一次產(chǎn)生9216個(gè)反應(yīng)。集成流體通路只需要192步移液操作（與之相比，如果在384個(gè)微井的標(biāo)準(zhǔn)板片上進(jìn)行這樣規(guī)模的試驗(yàn)，需要完成18000多步移液操作）。